Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msx2Q03358 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms