Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Hivep1Q03172 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Hivep1Q03172 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms