Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smyd1P97443 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms