Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms