Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx1P82976 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gbx1P82976 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gbx1P82976 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gbx1P82976 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gbx1P82976 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gbx1P82976 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gbx1P82976 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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