Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptprn2P80560 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms