Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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