Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Hoxd13P70217 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Hoxd13P70217 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Hoxd13P70217 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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