Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Acta1P68134 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Acta1P68134 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Acta1P68134 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms