Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Crip1P63254 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms