Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms