Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CgnP59242 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CgnP59242 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CgnP59242 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CgnP59242 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CgnP59242 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CgnP59242 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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