Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

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Length 760 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Strn4P58404 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Strn4P58404 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Strn4P58404 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Strn4P58404 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Strn4P58404 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Strn4P58404 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Strn4P58404 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Strn4P58404 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Strn4P58404 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Strn4P58404 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Strn4P58404 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Strn4P58404 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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