Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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CtnsP57757 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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CtnsP57757 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtnsP57757 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CtnsP57757 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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