Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms