Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms