Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrpP56473 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrpP56473 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms