Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GferP56213 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GferP56213 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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