Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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