Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcanP55066 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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NcanP55066 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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NcanP55066 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NcanP55066 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcanP55066 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcanP55066 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcanP55066 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcanP55066 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcanP55066 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcanP55066 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcanP55066 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcanP55066 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcanP55066 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcanP55066 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcanP55066 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcanP55066 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcanP55066 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms