Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PctpP53808 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PctpP53808 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PctpP53808 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PctpP53808 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms