Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CastP51125 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CastP51125 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CastP51125 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CastP51125 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CastP51125 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CastP51125 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms