Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cox8bP48772 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms