Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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VdrP48281 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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VdrP48281 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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VdrP48281 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VdrP48281 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
VdrP48281 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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