Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrprbP47758 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms