Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms