Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms