Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms