Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tsta3P23591 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tsta3P23591 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tsta3P23591 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Tsta3P23591 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tsta3P23591 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tsta3P23591 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tsta3P23591 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tsta3P23591 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Tsta3P23591 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tsta3P23591 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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