Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms