Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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