Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NelfeP19426 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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NelfeP19426 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NelfeP19426 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms