Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtpraP18052 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PtpraP18052 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PtpraP18052 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PtpraP18052 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PtpraP18052 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PtpraP18052 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PtpraP18052 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PtpraP18052 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PtpraP18052 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtpraP18052 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PtpraP18052 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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PtpraP18052 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpraP18052 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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PtpraP18052 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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PtpraP18052 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpraP18052 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpraP18052 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms