Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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