Protein–RNA interactions for Protein: P04945

Ig kappa chain V-VI region NQ2-6.1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04945 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P04945 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04945 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04945 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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