Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ccl20O89093 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ccl20O89093 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ccl20O89093 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ccl20O89093 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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