Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffaO54786 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffaO54786 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms