Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FxnO35943 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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FxnO35943 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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