Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ebi3O35228 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms