Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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