Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MttpO08601 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MttpO08601 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
MttpO08601 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MttpO08601 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MttpO08601 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MttpO08601 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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MttpO08601 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MttpO08601 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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MttpO08601 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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MttpO08601 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MttpO08601 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MttpO08601 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms