Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms