Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm3415J3QMS8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm3415J3QMS8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm3415J3QMS8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms