Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ScaperF8VQ70 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms