Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Defa35E9QLQ1 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Defa35E9QLQ1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Defa35E9QLQ1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Defa35E9QLQ1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Defa35E9QLQ1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Defa35E9QLQ1 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Defa35E9QLQ1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Defa35E9QLQ1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Defa35E9QLQ1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Defa35E9QLQ1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Defa35E9QLQ1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa35E9QLQ1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms