Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms