Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddx60E9PZQ1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms