Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms