Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gcn1E9PVA8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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