Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ube2d4D3YUH6 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms